讲述疯狂博士苏伦野心勃勃，藉着武器毁灭宇宙，并走到一处没有时空界限的领域，进行连串恐怖计划。为了挽救人类安危，23世纪的太空船进取号舰长詹姆斯·柯克掉入时空，与24世纪的进取号舰长比皮卡德会合，阻止邪恶博士阴谋行动。