《机动战士高达THE ORIGIN》是在30年前首播的高达系列元祖作品《机动战士高达0079》为蓝本改编的作品，故事中的机体造型都重新设计。宇宙世纪0079年，SIDE-3的吉翁公国对地球联邦发动了战争，在吉翁新兵器的威力下，联邦军毫无招架之力，於是决定秘密开发新兵器——高达来对抗。