有一天小智和皮卡丘们来到了高科技城市拉鲁斯市。想在这里的对战塔和其他的精灵宝可梦进行战斗。小智巧遇一名少年而他就是小超。小超因为四年前的事，让他完全无法和精灵宝可梦相处。小智和皮卡丘在知道这样的情形后积极帮小智克服这问题。这时候突然出现了神秘精灵宝可梦代欧奇希斯。他的目的到底是什么？以高科技城市为舞台，即将展开精灵宝可梦史上最大的冒险！